Не скажу, что я любитель и частый пользователь Яндекс.Денег, но когда приходилось пользоваться, то использовать Яндекс.Деньги через программу Яндекс Кошелек мне было крайне удобно. Хоть она и не блистала дизайном и особыми наворотами, но это было всегда быстрее, чем пользоваться веб-интерфейсом Яндексовских денег.
Мне неизвестно по каким причинам программу упроздняют, видимо, хотят все сервисы подключить к единому паспорту на яндексе. Я уже совершил несколько платежей через веб-фейс Яндекс Денег - неудобно. Для оплаты чего-либо приходится вводить пароль дважды, сначала - авторизовываемся на Яндексе как обычно, затем еще раз вводим пароль - платежный пароль для совершения всех операций с Яндекс Деньгами.
Надеемся, что все, что делается - все делается к лучшему.